This may be a son or a relative
AGI, Pasajeros, L.2, E.5423 [Oct. 12, 1538, Francisco de Alvarado, son of Hernando de Alvarado y María Velázquez, vecino of Fresneda, in the armada of Pedro de Alvarado];
AGI, Pasajeros, L.2, E.5574 [Oct. 25, 1538, Luis and Hernando de Alvarado, sons of Juan de Alvarado and María de Trejo, vecinos of Mirandilla, in the armada of Pedro de Alvarado];
AGI, Indiferente General, 1417, L.1 [fol.54-55: naming him factor de las islas de la provincia de poniente, por muerte de Alonso de Alvear, June 12, 1540];
AGI, Indiferente General, 424, L.22 [fol.13r-14r: Oct. 9, 1549, 100 black] slaves to Indias
AGNEP, Notaría 3, Caja 1, Carpeta 1.10, Andrés de Herrera [1552 Hernando de Alvarado, witness to poder in Puebla, 9 November 1552, no signature on copy];
AGI, Patronato, 219, R.9, “Proceso contra Hernando de Alvarado: rebelión Nueva España” and AGI, Patronato, 203, R.5, “Averiguacón sobre sublevados : rebelión de Nueva España” [Hernando de Alvarado, son of Pedro de Medinilla and doña Isabel de Alvarado, native of Mexico, accused and sentenced in the Cortés rebellion, is probably nephew of Pedro and Jorge];
AGI, Patronato, 182, R.3 [October 1561, Guadalajara, Límites de Nueva Galicia; interrogatorio asks whether the witnesses know Rodrigo de Frías, vecino de Guadalajara and alcalde mayor of the mines of Comanja y Señora que estan en este reino; and whether they know don Diego de Guevara, alcalde mayor que fue de este reino [Nueva Galicia]; central issue is whether the Rio Grande as far as Querétero is one of the boundaries of Nueva Galicia; Guanajuato and the valle de Oxitipa are also involved; petition mentions that Francisco Vázquez de Coronado, gobernador que fue, conceded Querétaro to Pedro Vázquez, vecino de Compostela; then de la Torre gave it to Francisco Barron, vecino de Guadalajara; a Pedro Gómez de Contreras is mentioned as a former teniente de alcalde mayor en las minas de Guanajuato; then "vuestra audiencia deste reino proveydo a Rodrigo de Frías, vecino de Guadalajara por alcalde mayor y justicia en las minas nuevas que se han descubierto en las sierras de Comanja que estan mucho mas cercanas a esta dicha ciudad [Guadalajara]...y estando el dicho alcalde mayor Rodrigo de Frías administrando e haciendo justicia un Juan de Jaso, vecino de la ciudad de México, con mano armada y gente que consigo trajo...;" Jaso went to where Frías was "con vara alta y con mucha gente armada y entro en las dichas minas...y le quito la vara que asi tenia en las manos forzablemente...y le maltrato e le trajo su persona;" Jaso had a provisión from Luis de Velasco; Pedro de Ledesma is one of the signatories to the petition, as a regidor of Guadalajara; Juan Tellez, escribano público, mentions ongoing pleitos with Cristóbal Pérez and Álvaro Ruiz, procuradores de la audiencia real de Nueva España, and with several other persons; an Hernando Alvarado, estante en Guadalajara, is a witness in November 1561; according to interrogatorio, Nuño de Guzmán granted Querétaro to Lope de Samaniego; "por fin y muerte del dicho Lope de Samaniego Francisco Vázquez de Coronado, gobernador que fue...deposito el pueblo de queretaro en Pero Vázquez, vecino de la ciudad de Compostela;" a witness to the presentation of witnesses is Francisco Roxo, vecino de Guadalajara; witnesses called include Rodrigo de Frías and Alonso Martín, vecinos de Guadalajara; Alonso Martín is a conquistador of Nueva Galicia, more than 55 years old; he only heard about Vázquez de Coronado substituting Pedro Vázquez for Lope de Samaniego; according to witness Diego Hurtado, "Pedro Vázquez vino a este reino al tiempo que el gobernador Francisco Vázquez de Coronado volvio de la conquista de Cíbola...y el dicho Francisco Vázquez lo tenia por suyo [because Pedro Vázquez had lost his mind] e ? xaramyllo trato pleito sobre ello e este vido que paso en el año de quarenta e tres"];
AHMC, Caja A7, exp. 18 [March 28, 1575, "El mercader Alonso Carrillo contra Juan Fernández Ladrillero, por deudas"; Alonso de Mesa, merchant; witness: Hernando de Alvarado, vecino of Colima, fol. 1-7];
AHMC, Caja A8, exp. 19, document 282 [p.68-70: March 7, 1580: poder de Isabel de Trejo, escribano Francisco López Avecilla; witness is an Hernando de Alvarado, vecino of Colima];
Acuña, René, ed., Relaciones Geográficas del Siglo XVI: Michoacán, vol. 9 [Motines: 1580; Hernando de Alvarado, alcalde mayor for provincia of Colima and Motines, moved the old villages to the present day sites (p.158)];
ARChV, Sala de Vizcaya, Pleitos, Caja 2969,7 [1587, Pleito de María de Hoyo, viuda, de Burgos, Diego de Alvarado y Antonio de Ochandiano, de Orduña sobre Restitución de ciertos bienes raíces que quedaron de Hernando de Alvarado. Maria de Hoyo/Hoyos, widow of Diego de Alvarado, vecino de Burgos; 7 July 1587-then it says she is the widow of Hernando de Alvarado and tutriz y curadora of Mariana de Alvarado, Beatriz de Alvarado, her and Hernando's daughters; Antonio de Ochandiano, native and citizen of Orduña, says that he is the universal heir of Sancha López de Aguinaga, Hernando's first wife; her will was delivered in 1566; property consists of vineyards; the case can proceed];
AHJ, Escribanos, No.1, Rodrigo Hernández Cordero, v.1 [fol. 99v: September 14, 1587, almoneda of the goods of Juan Antonio Carmona, an Hernando de Alvarado purchases "un coco onacar de la china pintado"];
Palomino y Cañedo, Protocolos de Rodrigo Hernández Cordero [fols. 81r-82v: 1587, Guadalajara, will of Juan Antonio de Carmona, clerigo; Hernando de Alvarado buys items at auction; signs as witness to a pregon];
AHJ, Escribanos, No.1, Rodrigo Hernández Cordero, 1583-1590, v.2 1589-1590 [Will of Gaspar Baca de Ayala, son of Luis Vaca and doña Isabel de Ayala: Auction: Hernando de Alvarado bought un jubon de tafetan labrado for 10 pesos 7 tomines, fol. 507r];
Palomino y Cañedo, Protocolos de Rodrigo Hernández Cordero, #37 [II, fols. 499r-503v: 1 Feb. 1590, will of Gaspar Vaca de Ayala: Guadalajara; buys items at auction];
Palomino y Cañedo, Protocolos de Rodrigo Hernández Cordero, #51 [II, fols. 664r-665v: 16 July 1590, Guadalajara, will of Sebastián Macarro; witness to the signature on the will, vecino, more than 40 years old; was present in Compostela when the will was executed];
Orozco y Berra in Dorantes de Carranza, Sumaría relación, 424, 426 [listed as conqueror in Guatemala, and as regidor];
AGI, Contratación, 5536, L.5 = AGI, Pasajeros, L.2, E.3644 [info seems mixed up];
Tello, Libro Segundo [p.130/416: captain, [related to Pedro de Alvarado] [doesn't seem correct since Hernando is from a different part of Spain and certainly with different parents than Jorge de Alvarado, the brother to Pedro];
Pereda López, emigracion burgalesa [p.117 - vecino of Burgos, son of Garcia López de Alvarado y María de Mena; license to Peru 17 May 1537; 1540 with fray Juan de Padilla to discover the Mar del Sur; historian Thayer Ojeda says he perished in the battle of Marihueñu in 1554, in Chile];